Hitman, Part Time Killer est un manga mettant en scène un modeste employé de bureau, toujours prêt à rendre service. Marié à la sublissime (mais autoritaire) Misako, il va se retrouver dans une drôle de situation. En cherchant à réparer une bévue d'un de ses collègues, le voici qui renverse un inconnu. Il s'agit du célèbre tueur à gages Double Flingue, mortellement blessé, et qui git désormais à côté d'un de ses victimes. Avant de rendre l'âme, Double Flingue demande à Tokichi de remplir son contrat et de délivrer sa petite amie, sinon lui et sa femme seront exécutés. En cas de succès, Tokichi remportera toute la fortune du tueur.

Le modeste salary men va endosser avec un certain entrain le costume de tueur, et devra se faire passer pour Double Flingue, que personne ne doit penser mort. Tokichi débute alors une double vie, et pourra compter sur l'assistance de Chinatsu, l'ancienne petite amie de Double Flingue qui risque de lui gâcher quelque peu la vie. Toutefois, sa formation est encore loin d'être terminée. Alors qu'il aspirait au calme, Tokichi devra non seulement réaliser une mission de protection, mais également accomplir un pénible travail de bureau. Et ce n'est pas tout : Le chef Tahara a été enlevé et pour le délivrer, il faudra verser une rançon de 500 millions de Yens. Accompagné de Chinatsu et de Blondinet (son "stagiaire"), Tokichi va se retrouver comme simple pion dans un jeu entre tueurs. Et si cela ne suffisait pas, voici que Misako décide de suivre Tokichi, car elle le suspecte d'entretenir une liaison extra conjugale. Autant dire que Tokichi n'en a pas encore fini ...